El Viceministerio de Administración de Cuencas Hidrográficas se encarga de generar, ejecutar, evaluar y fiscalizar las políticas, planes, programas, normativas, proyectos en materia de administración de cuencas hidrográficas y embalses a fin de fortaleciendo la gestión integral del agua.
De igual forma, se ocupa del resguardo y seguridad de las operaciones de los embalses, la infraestructura hidráulica; además de la gestión de riesgos, adaptación y mitigación, ante inundaciones o sequías, considerando los principios de gestión integral del Servicio Hídrico Nacional.
Establecer lineamientos conjuntamente con los otros Despachos de Viceministros o Viceministras del Ministerio, para la elaboración y actualización del Plan Nacional de Gestión Integral de las Aguas.
También, velar por el correcto funcionamiento del Consejo Nacional de las Aguas, los Consejos de Región Hidrográfica y los Consejos de Cuencas Hidrográficas previstos en la normativa que rige la materia de aguas.
Tres direcciones integran este viceministerio:
• Dirección General de Administración de Cuencas Hidrográficas
• Dirección General de Manejo de Embalse
• Dirección General de Mitigación y Control de Inundaciones